Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc179J3QM76 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms