Protein–RNA interactions for Protein: J3QM57

Gm21783, Predicted gene, 21783, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21783J3QM57 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21783J3QM57 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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