Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zfp994J3QM38 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zfp994J3QM38 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zfp994J3QM38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Zfp994J3QM38 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zfp994J3QM38 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zfp994J3QM38 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp994J3QM38 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp994J3QM38 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp994J3QM38 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp994J3QM38 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp994J3QM38 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp994J3QM38 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp994J3QM38 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp994J3QM38 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp994J3QM38 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms