Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn34c3J3QJW5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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