Protein–RNA interactions for Protein: J3KMT3

Gm6882, Predicted gene 6882, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6882J3KMT3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm6882J3KMT3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6882J3KMT3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms