Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AK157302I3ITR1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AK157302I3ITR1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms