Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20696H3BJN7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20696H3BJN7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms