Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn20G5E8X0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn20G5E8X0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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