Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r34G3XA52 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r34G3XA52 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms