Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r58G3X9U3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms