Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933408B17RikG3X9B4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933408B17RikG3X9B4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms