Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r76F8VQ63 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r76F8VQ63 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms