Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms