Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zc3h7bF8VPP8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zc3h7bF8VPP8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms