Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm28038F7BCN9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm28038F7BCN9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm28038F7BCN9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm28038F7BCN9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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