Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8444F6XS56 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8444F6XS56 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms