Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms