Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms