Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc74aE9Q9U8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms