Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms