Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DspE9Q557 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DspE9Q557 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DspE9Q557 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms