Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrp3E9Q1T6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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