Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r68E9Q0V3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms