Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Fndc1E9Q043 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fndc1E9Q043 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc1E9Q043 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms