Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a3E9PWQ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a3E9PWQ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms