Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms