Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms