Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clca3bE9PUL3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms