Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rdh8D3Z6W3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh8D3Z6W3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms