Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms