Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms