Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms