Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4950D3YUM8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms