Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2d4D3YUH6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms