Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17333C6EQI3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms