Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms