Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700018F24RikB2RW27 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
1700018F24RikB2RW27 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms