Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7aB2RT54 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7aB2RT54 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms