Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf518bB2RRE4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf518bB2RRE4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms