Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbed5B2RPU8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed5B2RPU8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed5B2RPU8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed5B2RPU8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed5B2RPU8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed5B2RPU8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed5B2RPU8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed5B2RPU8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed5B2RPU8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbed5B2RPU8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms