Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik3B1AS29 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik3B1AS29 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms