Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm6880A3KG45 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm6880A3KG45 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm6880A3KG45 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm6880A3KG45 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm6880A3KG45 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm6880A3KG45 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm6880A3KG45 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Gm6880A3KG45 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm6880A3KG45 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm6880A3KG45 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm6880A3KG45 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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