Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms