Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samt1A2BED8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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