Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Lcn6A2AJB9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Lcn6A2AJB9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lcn6A2AJB9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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