Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc163A2AGD7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms