Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2dnl2A2AFH2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms