Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Myom3A2ABU4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Myom3A2ABU4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Myom3A2ABU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Myom3A2ABU4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Myom3A2ABU4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Myom3A2ABU4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Myom3A2ABU4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Myom3A2ABU4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myom3A2ABU4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms