Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700023F06RikA2AB62 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700023F06RikA2AB62 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms