Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms